Protein–RNA interactions for Protein: E9PAM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PAM4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PAM4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PAM4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PAM4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PAM4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E9PAM4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E9PAM4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E9PAM4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E9PAM4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PAM4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PAM4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PAM4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PAM4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PAM4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PAM4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PAM4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PAM4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PAM4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PAM4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PAM4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PAM4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PAM4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PAM4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PAM4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
E9PAM4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PAM4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PAM4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PAM4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PAM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PAM4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PAM4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PAM4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms