Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms