Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC69A6NI79 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms