Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLCD2A6NGC4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLCD2A6NGC4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms