Protein–RNA interactions for Protein: A6NDS4

TBC1D3B, TBC1 domain family member 3B, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3BA6NDS4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBC1D3BA6NDS4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms