Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
XCL2Q9UBD3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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