Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TCF23Q7RTU1 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms