Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CREMQ03060 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
CREMQ03060 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CREMQ03060 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CREMQ03060 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms