Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SSBP2P81877 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms