Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCNAP12004 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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