Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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