Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms