Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHPF2Q9P2E5 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms