Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USP34Q70CQ2 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms