Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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