Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MAP3K9P80192 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MAP3K9P80192 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms