Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC1P78348 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms