Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SH3BP2P78314 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BP2P78314 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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