Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SH3BGRP55822 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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