Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F8A0AVK6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms