Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms