Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP70

AMBN, Ameloblastin, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBNQ9NP70 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AMBNQ9NP70 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms