Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-201ENST00000327702 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-203ENST00000344100 6634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NLRC5-201ENST00000262510 6822 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms