Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SIRT1Q96EB6 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms