Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IMPG1Q17R60 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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