Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL359317.2-201ENST00000554898 1826 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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LSAMPQ13449 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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LSAMPQ13449 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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LSAMPQ13449 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CNBD2-204ENST00000489667 2531 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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