Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms