Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms