Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC027237.4-201ENST00000560870 694 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 TBC1D21-203ENST00000562056 965 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 MIR3689A-201ENST00000578854 78 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 AL157392.3-218ENST00000600249 773 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 KRTAP10-9-203ENST00000616529 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHP20396 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC092295.2-201ENST00000592087 1392 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 NPIPB2-202ENST00000399147 1194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 GAMTP2-201ENST00000430917 463 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 C9orf147-203ENST00000460965 446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 SSPN-207ENST00000540266 587 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHP20396 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 RPSAP19-201ENST00000431241 880 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 POLR2H-205ENST00000443489 807 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 GAPDHP1-201ENST00000452570 1005 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC068620.1-201ENST00000470544 798 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 WASH6P-207ENST00000476066 720 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC010542.3-202ENST00000561728 701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 FGF11-205ENST00000575398 990 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC010271.2-201ENST00000614440 588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AL513485.1-201ENST00000617915 845 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC012593.1-216ENST00000626183 444 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 PGAP2-235ENST00000532523 1696 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHP20396 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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