Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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