Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms