Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LPIN3Q9BQK8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms