Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM47Q96LD4 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms