Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms