Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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NBR1Q14596 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NBR1Q14596 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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