Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms