Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms