Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLIP2Q9UDT6 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms