Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ABI3Q9P2A4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms