Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 UNC45B-201ENST00000268876 5679 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms