Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UBE2E2Q96LR5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms