Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF397Q8NF99 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms