Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMS2P11Q13670 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms