Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CREMQ03060 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CREMQ03060 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms