Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBP2P32456 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBP2P32456 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GBP2P32456 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms