Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EPB42P16452 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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EPB42P16452 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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EPB42P16452 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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EPB42P16452 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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EPB42P16452 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EPB42P16452 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EPB42P16452 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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