Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PPARGC1AQ9UBK2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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