Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms