Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RRBP1Q9P2E9 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms