Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms